由于果酒度數較低，酒體中果膠、黃酮、蛋白質、纖維素等極易受條件變化，一些果酒批發存放一段時間后，會出現一些的沉淀物，這些沉淀物顏色較深并且部分呈結晶狀，所以很多消費者認為這是果酒變質的信號，實際上，這瓶果酒并沒有變質，并且完全可以放心飲用，因為這些沉淀物是水果中的果膠及蛋白質等，由于條件變化析出的一種沉淀，屬于正常現象。

常飲紅酒的人應該發現葡萄果酒的底部都有一個小深溝，這是因為果酒中的固形物，果酒批發一段時間后會凝聚沉淀下來，果酒小深溝就是讓沉淀物落在溝時，不易分散。而宴會上飲用價格昂貴的陳年葡萄酒，都用白布把酒瓶包起來，斜放在小藍子里，飲用時輕輕倒酒，以免酒瓶底部的沉淀物搖動而漂浮起來，影響酒的外觀。

果酒可以正常飲用，這是因為新裝的果酒中往往會存在一些不穩定物質，這些物質不容易與酒結合在一起，所以會擾亂果酒的口感。但是果酒廠家經過一段時間的貯存以后，這些不穩定物質與酒本身產生反應，變成結晶，可以這么說，沉淀物的產生是水果酒整個生產過程中的一個必經階段，果酒從某種角度上來說，出現沉淀物也是果酒成熟的標志，這時候的果酒，結構更緊密，口感更醇厚潤滑。

果酒是個復雜膠體的混合物，在不同的貯存條件下，部分果酒出現不同程度的沉淀，不影響正常飲用。